廢水中含有大量的含碳性和含氮性有機物，其中含碳性有機物主要是碳、氫和氧。其中的基本元素有氮，硫，磷。在好氧分解過程中，含氮有機物最終會轉化為無機物，如氨氮、亞硝酸鹽、硝酸鹽、水和二氧化碳。普通進口廢水中的氨氮含量在30~70mg/L左右。進廠水一般不含亞硝酸鹽和硝酸鹽。二級污水處理廠一般不能進行大量的脫氮處理，處理程度高的部分氨氮可以轉化成硝酸鹽氮。

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